Die BKI Angaben sind m.E. Bruttopreise. Es wäre also davon auszugehen, das die schweizer Baukosten dann auch Brutto sind.
Es gibt übrigens, wie ich jetzt erfahren habe eine BKI Landkarte mit Regionalfaktoren 2012:
Regionalfaktoren - BKI Website
In dieser Karte gibt es dann auch noch einen EU weiten Vergleich, demnach ist die Schweiz wohl um 14,4% teurer als Deutschland - so wurde es mir gesagt. (Ich habe die Karte selber nicht gesehen und der Wert könnte auch von 2010 oder 2011 sein.)