Egal, welches Programm: Check mal den Drucker, ob da nicht "Anpassen auf Seitengröße" eingestellt ist. Besonders wenn die Abweichungen minimal sind, liegt der Verdacht nahe.

Ansonsten kann ich dir auch nicht helfen, es gibt Programme mit Ebenen, Klassen, Druckbereiche, Layout etc. etc.

Das einfachste ist vermutlich ein PDF-Writer, der mit dem Drucker kooperiert, z.B. PDF 24. Dann stellst du im Drucker 200% ein und zoomst eben zu dem entsprechenden Ausschnitt zuvor (im Drucker "sichtbaren Ausschnitt" anwählen) und guckst dir die Vorschau vom Drucker an, um dich ggf. einzuruckeln, dass der Auschnitt auch stimmt.
Dafür darfst du natürlich nicht im Layoutbereich sein in deinem Programm.